6月3号，在东京都内公布了2020年东京奥运会马拉松参赛代表选手选拔会MGC（马拉松冠军赛，9月15日）的参赛选手。通过大约2年时间的一系列比赛等的选拔，男子组有34名选手获得了参赛资格、女子组有15名选手获得了参赛资格。除了将参加今年秋天的多哈世界田径锦标赛（9月27日开幕）的选手之外，男子组将有31名选手，女子组将有12名选手参加MGC比赛。
男子组有创下2小时5分50秒的日本纪录的大迫杰选手（27岁）和曾创下过日本纪录的设乐悠太选手（27岁）等选手参赛。女子组有以连续5次参加奥运会为目标的福士加代子选手(37岁)等优秀选手参赛。日本田径联合会的濑古利彦马拉松强化战略项目负责人（62岁）说：“终于等到这一天了。我非常期待选手们的出色表现。”
9月15日，男子组从8点50分开始，女子组从9点10分开始，将选出2020东京奥运会马拉松比赛项目3名参赛选手中的2名。
以下是MGC参赛选手（括号内的数字是年龄）。
【男子组】
村泽明伸<28>（日清食品集团）
大迫杰〈27〉（耐克）
上门大佑<25>（大冢制药）
竹内佳树<27>（NTT西日本）
园田隼〈30〉（黑崎播磨）
设乐悠太<27>（本田）
井上大仁<26>（MHPS）
木滑良<28>（MHPS）
宫胁千博<27>（丰田汽车）
山本宪二<29>（马自达）
佐藤悠基<32>（日清食品集团）
中村匠吾<26>（富士通）
冈本直己〈35〉（中国电力）
谷川智浩<30>（柯尼卡美能达）
大冢祥平〈24〉（九电工）
中本健太郎<36>（安川电机）
服部勇马〈25〉（丰田汽车）
福田登〈28〉（西铁）
桥本崚<25>（GMO运动员）
岩田勇治<31>（MHPS）
堀尾谦介<22>（丰田汽车）
今井正人〈35〉（丰田汽车九州）
藤川拓也〈26〉（中国电力）
山本浩之〈33〉（柯尼卡美能达）
河合代二〈27〉（托埃内克）
藤本拓〈29〉（丰田汽车）
神野大地<25>（赛尔代码）
高久龙<26>（益力多）
荻野皓平<29>（富士通）
一色恭志<24>（GMO运动员）
铃木健吾<23>富士通
【女生组】
前田穗南〈22〉（天满屋）
松田瑞生〈24〉（大发饰）
安藤友香<25>（华歌尔）
关根花观<23>（日本邮政集团）
岩出玲亚<24>（アンダーアーマー）
野上惠子<33>（十八银行）
铃木亚由子<27>（日本邮政集团）
福士加代子〈37〉（华歌尔）
上原美幸〈23〉（第一生命）
前田彩里<27>（大发饰）
小原怜<28>（天满屋）
一山麻绪<22>（华歌尔）